Ученый радикально перестроил систематику гельминтов, выявил филогенетическую взаимосвязь между ними, описал более 200 новых видов, обосновал более 100 родов, его именем названо более 200 гельминтов. Герой Социалистического Труда К. И. Скрябин являлся действительным членом Академии наук СССР, членом Академии сельскохозяйственных наук имени В. И. Ленина и Академии медицинских наук СССР, а также многих зарубежных академий. Лауреат Ленинской и Государственных премий К. И Скрябин организовал Всесоюзный институт гельминтологии, которому было присвоено его имя (ВИГИС) и гельминтологическую лабораторию при Академии наук СССР.
Многочисленные экспедиции, организованные К. И. Скрябиным, позволили в невиданно короткий срок изучить гельминтофауну страны. Исследователи описали большое количество новых видов гельминтов, раскрыли циклы их развития и положили начало разработкам средств борьбы с гельмннтозами. Обосновал учение о девастации - комплекса наступательных лечебно-профилактических мероприятий, направленных на последовательное освобождение человека и полезных животных от наиболее патогенных гельминтов.
