Территория области дренируется густой сетью рек, наиболее крупные из которых — Витим (среднегодовой расход — около 2000 м
з/ceк), Олёкма и Алдан — являются правыми притоками Лены. Большинство малых и средних рек — типичные горные потоки, относящиеся по своему режиму к рекам дальневосточного типа. Основная масса воды (до 70—80% годового стока) поступает в них от летних дождей; талые снеговые воды имеют меньшее значение.
У рек восточной половины области, стекающих с Алданского нагорья и северного склона Станового хребта, доля дождевого питания в связи с уменьшением летних осадков сокращается до 40—50%, но увеличивается сток талых снеговых вод (30—40%).
Зимой на реках области сток очень невелик — не более 4—5% годового; многие малые реки к середине зимы промерзают до дна, и в их русле местами образуются мощные наледи.