Горы Южной Сибири отличаются большим разнообразием своих природных ресурсов. Особенно богаты они различными полезными ископаемыми, и в первую очередь рудами цветных металлов. В Рудном Алтае и Забайкалье есть месторождения цинка, свинца, серебра, олова, ртути, золота, вольфрама, молибдена, а также драгоценных и полудрагоценных камней и минералов.
Большое значение имеют железные руды, которые залегают в недрах Горной Шории, Кузнецкого Алатау, Хакасии, Алтая, Тувы, Саян, Забайкалья. В Кузнецком Алатау и Восточном Саяне есть марганец и титан. В межгорных котловинах располагаются крупные каменноугольные бассейны (Кузнецкий, Минусинский, Улуг-Хемский); в Забайкалье преобладают бурые угли. Другие, неметаллические ископаемые представлены слюдой, графитом, асбестом и строительными материалами.
Значительны также и водные ресурсы. Многочисленные быстрые горные реки, протекающие в скалистых ущельях и имеющие крутое падение, могут быть использованы как источники гидроэнергии.
Лесные массивы горных склонов отличаются высоким качеством древесины. Важную роль для развития животноводства играют высокогорные (субальпийские и альпийские) луга, а также луга горно-лесного пояса, особенно пастбища и сенокосы Алтая, Читинской области, Бурятии и Тувы.
Освоение природных ресурсов гор Южной Сибири связано, однако, с большими трудностями, чем в равнинных странах. Сильно пересеченный рельеф, узкие скалистые долины и бурные горные реки — серьезное препятствие для передвижения по территории горных районов, а суровый климат во многих местах исключает возможность земледелия.
Несмотря на это, в горах Южной Сибири во все возрастающих размерах идет освоение месторождений полезных ископаемых, лесных массивов и энергетических ресурсов. Неизмеримо выросла в последние годы традиционная отрасль хозяйства — животноводство; далеко в горы проникло земледелие. В настоящее время наиболее густо населены предгорные районы страны, и особенно равнинные пространства — Кузнецкая и Минусинская котловины, Рудный Алтай, степные районы Бурятии и Читинской области. В их пределах сформировались крупные индустриальные комплексы с предприятиями горнорудной, угольной, металлургической, химической, лесной, машиностроительной и легкой промышленности.