В основу таксономии микроорганизмов положены их морфологические, физиологические, биохимические, молекулярно-биологические свойства. Весь мир микробов подразделяется на три царства:
• царство эукариотов (грибы и простейшие);
• царство прокариотов (бактерии, риккетсии, микоплазмы);
• царство вирусов.
- подобны клеткам растений и животных. Они имеют поверхностную мембрану и внутриклеточную систему элементарных мембран, составляющих эндоплазматическую ретикулярную сеть и комплекс Гольджи. В цитоплазме эукариотов содержится оформленное ядро, митохондрии, рибосомы и ряд других органелл. Размножаются простые эукариоты половым и бесполым путями.
- - организмы, не имеющие отграниченного ядра, внутриклеточной системы элементарных мембран и митохондрий, а некоторые лишены также клеточной стенки. Размножаются простым поперечным делением или почкованием.
- - микроорганизмы неклеточной структуры, являющиеся абсолютными паразитами, репродукция которых внутри клеток происходит с помощью энергообменных систем клетки-хозяина.
Одной из основных таксономических категорий является вид (species) - совокупность особей, имеющих общий корень происхождения, сходный генотип и максимально близкие фенотипические признаки и свойства.
Совокупность однородных микроорганизмов, выделенных на питательной среде, характеризующаяся сходными морфологическими, тинкториальными (отношение к красителям), культуральными, биохимическими и антигенными свойствами, называется чистой культурой. Чистая культура микроорганизмов, выделенных из определенного источника и отличающихся от других представителей вида, называется штаммом. Штамм - более узкое понятие, чем вид или подвид. Близким к штамму является понятие клона; клон - это совокупность потомков, выращенных из одной микробной клетки.
Решением Международного конгресса для микроорганизмов рекомендованы следующие таксономические категории: царство, отдел, класс, порядок, семейство, род, вид. Название вида соответствует бинарной номенклатуре, т. е. состоит из двух слов. Например, кишечная палочка пишется как Escherichiacoli. Первое слово - название рода, которое начинается с прописной буквы, второе слово обозначает вид и пишется со строчной буквы. При повторном написании вида родовое название сокращается до начальной буквы, например E. Сoli.
Фирмикуты и грациликуты.
- (Gracilicutes) - группа бактерий, состоящая из огромного количества видов, Грам -, отличительной особенностью является тонкостенная клеточная стенка. Включает 9 секций:
- Спирохеты, включают 2 семейстаспирохеты и лептоспиры
- Спиралевидные и изогнутые аэробы, включают семейство спириллы
- Грам- неподвижные изогнутые бактерии
- Аэробные Грам- палочки и кокки
- ГРАМ- ФАКУЛЬТАТИВНЫЕ АНАЭРОБЫ, включают энтеробактерии, пастереллы и вибрионы.
- Строгие анаэробы, включающие 13 родов
- Сульфатредуцирующие бактерии
- Анаэробные Грам- кокки
- Реккетсии и хламидии
- (Firmicutes) - тип бактерий, включающий в свой список 2 класса (Bacilli, Clostridia) и множество семейств. Среди их представителей встречаются как полезные бактерии, так и патогенные (золотистый стафилокок, столбнячная палочка).
Отличительными особенностями всех Фирмикутов являются низкое содержание пар нуклеотидов Г—Ц (Гуанин-Цитозин) и грамоположительность бактерий.