Бічні корені закладаються ендогенно за рахунок клітин первинної кори, перициклу, серцевинних променів і камбію. Спочатку в місцях закладання бічного кореня клітини перициклу діляться, утворюючи меристематичний комплекс, якиїй називають коренерідною дугоюю. У процесі розвитку меристематичної зони утворюється конус наростання кореня з кореневих чохликом. Паралельно з наростання конуса відбувається формування кишеньки за рахунок поділу клітин ендодерми. Кишенька відіграє важливу роль для виходу бічного кореня назовні. Клітини кишеньки діють механічно на первинну кору, розсуваючи клітини, розсуваючи клітини, а також виділяють ензими і розчиняють клітинні обюолонки первинної кори, прикладаючи цим самим шлях для виходу конуса наростання. Бічні корені найчастіше закладаються проти ксилемних груп головного кореня.