Існує 4 способи окислення:
1. віднімання е- . Реакції, в яких спостерігається безпосередня втрата електрона в результаті зміни його валентності. Такі реакції каналізують і ферменти оксидази, в активних центрах яких є метали
2. віднімання водню. За рахунок вилучення з окиснюваної речовини водневих йонів за допомогою ферментів гідроксилази. Акцепторами протонів у таких реакціях часто є сам кисень.
3. приєднання О2. Пряме окиснення молекулярним киснем за допомогою оксигеназ або трансфраз
4. утворення проміжної гідратованої сполуки з подальшим відніманням двох електронів і протонів.
У біологічних системах усі ці шляхи взаємопов’язані, причому втрата електрона в разі окиснення супроводжується, як правило, і втратою водню. Саме тому процес окиснення певної речовини в живих системах поєднується з відновленням іншої.