У пострадянський період загострюються міжнаціональна напруженість, що виражається в ряді воєн (Хорватська, Боснійська і Косівська війна, конфлікт в Македонії) і в подальшому параді суверенітетів: з'являються нові освіти Республіка Македонія (1991), Чорногорія (2006), Косово (2008в основному югославські війни включали в себе ряд міжнаціональних конфліктів між сербами з одного боку і хорватами, боснійцями і албанцями з іншого, а також хорватсько-боснійський конфлікт в Республіці Боснія і Герцеговина та конфлікт між албанцями і македонцями в Македонії, викликані релігійними і етнічними протиріччями. Югославська війна стала найбільш кровопролитної в Європі після Другої світової війни. Для розслідування скоєних під час воєн злочинів був створений Міжнародний трибунал по колишній Югославії. в цілому югославські війни поділяється на три періоди:Конфлікти в період розпаду СФРЮ: Десятиденна війна в Словенії (1991): 25 червня 1991 року - в день одностороннього проголошення незалежності Словенії від Югославії - голова парламенту Словенії Мілан Кучан наказав своїм збройним формуванням захопити прикордонні пункти на словенському ділянці югославського кордону і блокувати казарми ЮНА в Маріборі і Любляні. В результаті неефективних дій югославського керівництва і зовнішньополітичного тиску з боку ЄС 7 липня було укладено Бріонского угоду, згідно з яким Югославія виводила свої війська з території Словенії, а Словенія брала мораторій на проголошення незалежності.Війна в Хорватії (1991-1995): спочатку війна велася між силами Югославської народної армії, хорватськими сербами і хорватськими поліцейськими. Керівництво Югославії силами федеральної армії спробувало зберегти Хорватію в складі країни [44]. Під час розпаду країни на території Хорватії було створено самопроголошену державу сербів - Республіка Сербська Країна. Потім почалася боротьба між хорватської армією і армією краинских сербів. У 1992 році було підписано угоду про припинення вогню, і було визнання Хорватії як суверенної держави. Війна закінчилася підписанням Ердутского і Дейтонських угод, згідно з якими Східна Славонія була включена до складу Хорватії в 1998 році [4
Боснійська війна (1992-1995): на території Боснії і Герцеговини, між Сербією і Чорногорією з одного боку, Республікою Боснією і Герцеговиною з другого та Республікою Хорватією з третього.Військові дії НАТО: Операція «Обдумана сила» (Боснія і Герцеговина, 1995,Війна НАТО проти Югославії (1999)Конфлікти в албанських районах: Косово(1998-1999): збройний конфлікт, що спалахнув в лютому 1998 року між албанськими повстанцями та Союзною Республікою Югославією. Бойові дії були ініційовані косовськими албанцями, що прагнули до незалежності Косова і Метохії, і привели до численних жертв серед цивільних осіб з обох сторін. У березні 1999 року в конфлікт втрутилася НАТО, яка почала бомбардування СРЮ. У червні 1999 року, згідно з Військово-технічною угодою, підписаною представниками НАТО і югославської армії в Куманово, контроль над краєм перейшов до сил KFOR. Відбувся масовий відтік неалбанського населення (сербів, чорногорців і циган) і численні злочини проти тих з них, хто залишився в краї. 17 лютого 2008 року косовські албанці проголосили Республіку Косово.Конфлікт в Македонії (2001) інтенсивні міжетнічні сутички між македонцями та албанськими сепаратистськими угруповуваннями що мали місце з січня по листопад 2001 року. Формально завершився підписанням Охридських домовленостей 13 серпня 2001 року.
