Колишня Чехословаччина офіційно визнала державну незалежність України 8 грудня 1991 року.Станом на початок 2012 року Чеська Республіка інвестувала в українську економіку 76,9 млн дол. З кінця 2010 року спостерігалося певне похолодання в українсько-чеських відносинах. Це значною мірою було пов'язане з наданням Чеською Республікою політичного притулку колишньому міністру уряду Ю. Тимошенко Богдану Данилишину. На 1999 р. склався комплекс дружніх і партнерських відносин двох країн, що у 2000-2003 рр. виявився у широкомасштабному торговельно-економічному співробітництві. У ці роки відносини між країнами були достатньо активними, але не безпроблемними. Уже в 2000 р. ЧР, відповідно до вимоги ЄС, заявила про денонсацію Договору про безвізовий режим для громадян України, а в 2003 р. денонсувала ще чотири угоди про: співпрацю в сільському господарстві; економічне і науково-технічне співробітництво; торговельні відносини; співпрацю в галузі ветеринарної медицини. Це посилило політичну складову в співробітництві двох країн.Проблемним специфічним питанням українсько-чеських відносин залишається погашення "ямбурзької" заборгованості України перед ЧР згідно з укладеною 30 червня 1997 р. Угодою "Про умови завершення реалізації після 1 січня 1992 р. на території України Угоди між Урядом СРСР і Урядом ЧССР про співробітництво в освоєнні Ямбурзького газового родовища, будівництві магістрального газопроводу Ямбург - Західний кордон СРСР і об'єктів Уральського газового комплексу та пов'язані з цим поставки природного газу з СРСР до ЧССР від 16 грудня 1985 року", яка була ратифікована Верховною Радою України. Цим питанням цікавиться чеська сторона практично під час усіх двосторонніх переговорів.Відповідно до міжурядової Угоди, що набула чинності 1999 р., Україна визнала борг на суму 79,17 млн умовних розрахункових одиниць природного газу. Стан розв'язання питання заборгованості України перед Чеською Республікою згідно з Ямбурзькими угодами був розглянутий на другому спільному засіданні українсько-чеської Змішаної комісії з питань економічного, промислового та науково-технічного співробітництва 17 червня 2008 р. у Празі. Сторони домовились про спільну роботу з вивчення всіх взаємоприйнятних варіантів погашення заборгованості УкраїниУ 2011 р. помітно пожвавилась культурно-освітня українсько-чеська співпраця.Національний педагогічний університет ім. М. Драгоманова в Празі створений у 2003 році. Працює за окремою угодою з НПУ ім. М. Драгоманова (м. Київ), за його навчальними програмами і робочими планами. Отже, відносини між Україною та Чеською Республікою характеризуються динамічним розвитком співробітництва у політичній, економічній і культурній сферах, активним формуванням договірно-правової бази, розвитком неформальних міжлюдських контактів. Яскравим прикладом такого співробітництва є хоча б той факт, що 1995 р. Україна стала членом Ради Європи під час головування у цій організації та за активної підтримки ЧР.Чеська Республіка підтримує євроінтеграційний курс України.
