Визначною подією стало ухвалення в листопаді 1641 р. "Великої Ремонстрації". В умовах зростання політичної напруги на початку січня 1642 р. Чарлз І покинув столицю й попрямував на північ, до Йорку. 22 серпня 1642 р. у м. Ноттінгем король підняв свій штан- дарт. Це був символічний жест, який здавна означав, що король скликає своїх васалів стати під його верховенство. Початок Громадянської війни був доволі млявим. Хоча перевага у матеріальних і людських ресурсах була на парламентському боці, близько 25 тис. вояків проти 12 тис., але королівські війська були більш досвідченими та дисциплінованими, що позначилось на результатах кампанії. Фактично на середину 1643 р. роялістська армія, завдавши низку поразок парламентським військам, загрожувала околицям Лондона. Після битви під Марстон-Муром в околицях Йорка (2 липня 1644 р.), де О. Кромвель командував парламентською кавалерією, яка вперше за весь час протистояння завдала відчутної поразки армії короля.Було створено армію нового зразка, Головнокомандувачем армії був призначений 33-літній Томас Ферфакс, а О. Кромвель - його заступником. Вирішальна битва між арміями короля та Парламенту, чисельність яких становила відповідно 8 і 14 тис. чол., відбулася 14 червня 1645 р. біля поселення Незбі. У травні 1645 р. король утік на північ до шотландців, розраховуючи на підтримку гірських кланів, очолюваних маркізом Монтрозом.. Вони, не дочекавшись від Чарлза І поступок, видали його Довгому Парламенту, отримавши винагороду в 400 тис. ф. ст.Війна позначилась на економічному розвитку Англії, порушивши господарські зв'язки між окремими регіонами; у країні установилося двовладдя. Парламент узаконив обгороджування, зроблені до початку його роботи; у травні 1643 р. було введено акцизний збір (непрямий податок) на головні продукти харчування та основні предмети повсякденного вжитку, що призвело до стрімкого зростання цін.23 вересня 1643 р. між Англією та Шотландією було укладено "Урочисту Лігу та Ковенант". У документі йшлося про зобов'язання щодо встановлення в обох країнах пресвітеріанського устрою церкви (принцип уніфікації церковної організації зафіксовано наприкінці 1644 р. у "Вестмінстерському сповіданні віри"). У лютому 1646 р. було видано спеціальний акт, яким Чарлз І позбавлявся права верховного сюзерена. Цим документом скасовувався інститут лицарського держання землі, лендлорди звільнялися від будь-яких феодальних зобов'язань на користь короля і таким чином визнавався приватний характер їхнього землі. володіння.