Отображение состояния растительности, подверженной антропогенному воздействию, может выступать как цель либо как средство картографирования. В первом случае (собственно биоэкологическое картографирование) в центре внимания оказываются доминантные и субдоминантные виды, группировки в целом, редкие виды, являющиеся предметом охраны, а также условия их существования. Во втором случае (биоиндикационное картографирование)изучаются виды, имеющие индикационное значение, вне зависимости от их роли в ассоциациях. Влияние условий существования исследователи стремятся снивелировать путем подбора равноценных. В обоих случаях источник информации — дистанционные, картографические или полевые исследования биоты, и указанные разновидности картографирования при практической реализации тесно переплетаются между собой. Составная часть биоэкологических проблем — изучение влияния (главным образом негативного) биоты на человека, что входит в задачи медико-географического картографирования.