С 1946 года госпиталь функционировал как специализированный гарнизонный госпиталь Юго-Западного, а затем Западного пограничного округа. Это обусловлено тем, что Одесский научно - исследовательский институт глазных болезней был тогда ведущим медицинским учреждением по лечению глазных болезней и последствий боевых травм глаз. В начале своего функционирования в госпитале были развернуты терапевтическое и хирургическое отделения, но со временем их количество увеличивалось, уровень медицинской помощи повышался. На сегодняшний день она предоставляется в объеме квалифицированной с элементами специализированной. Лечебно - профилактическая работа организована в 11 отделениях: приемном, поликлиническом, хирургическом, терапевтическом, кардиологическом, неврологическом, стоматологическом, рентгенологическом, физиотерапевтическом, лабораторном, а также в отделении анестезиологии, реанимации и интенсивной терапии и диагностических кабинетах. В клиническом госпитале успешно проводятся оперативные вмешательства офтальмологического профиля по замене хрусталика и для лечения глаукомы.
В разные годы госпиталь возглавляли: подполковники м/с Комиссаров П.Н., Яськов А.В., полковники м/с Ратников В.Ф., Коробицын В.Т., Казаринов В.В., Крылов В.Т., подполковник м/с Вдовиченко М.Д. и полковник м/с Риспаев У.Д., полковник м/с Попов Ю.Д.
В клиническом госпитале за последние годы введены в действие унифицированные стандарты медицинской помощи лечебно - диагностического процесса, а также условия, соответствующие современному уровню пребывания пациентов на лечении. На страже охраны и укрепления здоровья персонала Южного регионального управления Государственной пограничной службы Украины стоят около 155 военнослужащих и работников, из которых более 30 врачей имеют квалификацию врача высшей категории.
