1.Вирусоскопия– световая микроскопия крупных вирионов вирусов (Poxviridae), включений и изменений клетки. Так же используется электронная микроскопия, но этот способ дорогостоящий, сложный и не позволяет точно идентифицировать вирус.
2.Обнаружение телец-включений – это скопления вирионов, избыток белков вирионов, либо клеточный материал измененный под действием вируса.
Способность к окраске теми или иными красителями, размеры, форма, структура, местоположение в клетке телец-включений, образованных разными вирусами, неодинаковые, но специфичные для каждого вируса. Поэтому обнаружение в материале от больных животных внутриклеточных телец-включений с определенными характеристиками позволяет судить о том, каким вирусом они образованы, а значит, и о присутствии этого вируса в исследуемом материале. Для обнаружения телец-включений готовят мазки или отпечатки (посмертно или прижизненно), которые подвергают специальным методам окраски с последующей микроскопией. Окраска по Морозову – диагностика оспы (на светло-коричневом фоне, вирионы имеют вид темно-коричневых или черных точек, при массовом обнаружении р-т является положительным). По Муромцеву (нахождение телец Бабеша-Негри, они имеют вид фиолетовых образований различного размера на голубом фоне, ядро окрашивается в синий цвет). Так же используются: По макиавело, Романовскому-Гимзе, По Манну.
Вирус бешенства в цитоплазме нервных клеток обнаруживаются тельца Бабеша-Негри. Оспа в эпителиальных клетках – тельца Гварниери.
3.Обнаружение вирусных антигенов: серологические реакции (РДП, РН, РСК, РИФ и т.д.)
4.Обнаружение вирусных НК (ДНК-зонды, ПЦР и метод блоттинга).
5.Обнаружение активной формы вируса путем биопробы (лабораторные животные, куриные эмбрионы, культура клеток).
6.Обнаружение гемаглютининов у гемаглютинирующих вирусов (РА, РТГА, но в настоящее время практически не используется по причине наличия более точных методов).