Систематика – это теория многообразия организмов, изучающая отношения между таксонами.
Таксономия – это наименование таксонов, установления их границ между нами.
Таксон – это однородная группа организмов.
Классификация – это разделение множества организмов по таксонам.
Идентификация – это определение принадлежности микроорганизма к тому, или иному таксону (определение вида микроба).
Номенклатура – это правила присвоения названий.
Микроорганизмы относятся к следующим царствам:
- вирусы – включает только вирусы.
- прокариоты (безъядерные) – включает бактерии (эубактерии – настоящие, архебактерии – первобактерии и цианобактерии – сине-зеленые водоросли );
- эукариоты (ядерные) – включает простейшие и низшие микроскопические грибы;
Царство «прокариоты» включает: отдел – класс – порядок – семейство – род – вид. Вид является основной таксономической категорией.
Вид – это эволюционно сложившаяся совокупность особей, имеющая единый генотип, который в стандартных условиях проявляется сходными морфологическими, биохимическими и др признаками.
Вид может быть разделен на подвиды и варианты.
Подвиды отличаются небольшими типичными видовыми свойствами.
Варианты отличаются небольшими наследственными свойствами:
- Морфовары – морфологией;
- Биовары – биохимическими и физиологическими;
- Ферментовары – ферментативными;
- Патовары – патогенностью;
- Хемовары – по чувствительности к химическим веществам;
- Фаговары – по чувствительности к фагам;
- Серовары – по антигенной структуре;
- Эковары – по экологическим нишам, в которых они обитают.
Для наименования микроорганизмов принята двойная (бинарная) номенклатура. Каждой бактерии присваивается родовое и видовое название. Например: кишечная палочка – Escherichia coli [эшэрихия коли], где Escherichia – это название рода, + coli – вида.
Штамм – это культура бактерий одного и того же вида, выделенная из различных источников или даже из 1 источника, но в разное время.
Штамм – более узкое понятие, чем вид. Штаммы называют либо по источнику выделения (водный, кишечный), либо по местности, где он был выделен (вирус гриппа Гонконг, Сингапур).
Клон – это популяция (культура) бактерий, полученная из 1 бактериальной клетки.
Культура – это микроорганизмы, полученные от животного, человека, растения или субстрата внешней среды и выращенные на питательной среде.
Чистые культуры – состоят из особей 1 вида.
Смешанные культуры – представляют скопления клеток разных видов.