Структурно гипертекст может быть представлен как граф, в узлах которого находятся традиционные тексты или их фрагменты, а также изображения, таблицы, видеоролики и т.д. Узлы связаны разнообразными отношениями, типы которых задаются разработчиками программного обеспечения гипертекста или самим читателем. Отношения задают потенциальные возможности навигации по гипертексту. Отношения могут быть однонаправленными или двунаправленными. Соответственно, двунаправленное отношение между двумя узлами гипертекста позволяют пользователю двигаться в обе стороны, а однонаправленные — только в одну. Цепочка узлов, через которые проходит читатель при просмотре компонентов текста, образует путь или маршрут. Переходы между узлами гипертекста в частности могут осуществляться посредством гиперссылок.
Различные маршруты через различные последовательности узлов соответствуют различным способам прочтения гипертекста. Помимо маршрута, тип чтения гипертекста определяется также качественными характеристиками понимания информации, содержащейся в узлах. Медленное чтение предполагает внимательное знакомство с информацией каждого узла. Часто медленное чтение сопровождается заметками, которые читатель может привязывать к узлам гипертекста. Быстрое чтение — браузинг — наиболее часто используется в информационных системах, основанных на гипертекстовой технологии. При поиске конкретной информации пользователь быстро передвигается по узлам сети, маркируя нужные фрагменты. Для браузинга создается специальная программная поддержка.
Совокупность семантически смежных узлов образует окрестность данного узла. Узлы сети, связанные с другими узлами большим количеством стрелок-отношений, образуют центральную часть гипертекста, а те, которые почти изолированы от других узлов — его периферию.