Прибайкальская область дренируется густой речной сетью, которая принадлежит бассейну Байкала и вытекающей из него Ангары; лишь реки северо-западных склонов Байкальского хребта относятся к бассейну начинающейся здесь реки Лены. В Байкал впадает более 400 рек. Самые крупные из них — Селенга, бассейн которой составляет 83,4% всей водосборной площади озера, а также Верхняя Ангара, Баргузин и Турка. Остальные реки представляют собой небольшие горные потоки, питающиеся дождевыми и талыми водами. Байкал оказывает существенное влияние на режим Ангары, регулируя ее сток. Поэтому колебания расходов Ангары в ее истоках невелики: от 840 м
3/сек (апрель) до 4950 м
3/сек (сентябрь); среднегодовой расход — 1940 м
3/сек. Кроме того, массы относительно теплой байкальской воды надолго задерживают начало зимнего ледостава в верховьях Ангары (в среднем до конца января).