Снеговая линия в условиях континентального климата Алтая лежит высоко. Даже во влажных западных районах она не опускается ниже 2300 м. В Катунских и Чуйских Белках снеговая линия поднимается до 2500—3000 м на северных склонах и до 2600—3300 м на южных, а в массиве Табын-Богдо-Ола и хребте Чихачева она лежит на высоте от 3100 до 3500 м.
Все крупные ледники области относятся к типу долинных. Местами их языки заходят даже в лесную зону: ледники Мюшту-Айры и Катунский спускаются до высоты 1950 м. На крутых склонах встречаются небольшие висячие ледники, а на дне глубоких цирков — каровые. Почти 40% известных ледников сосредоточено в Катунском хребте; главным центром оледенения здесь является гора Белуха, со склонов которой сползают шесть больших долинных ледников (Катунский, Мюшту-Айры, Аккемский, Менсу, Большой и Малый Берельские). Крупные ледники расположены также в Южно-Чуйских Белках, горной группе Биш-Иирду и в восточной части Южного Алтая.
Современные алтайские ледники находятся в стадии отступания: за последние 130 лет нижняя часть Катунского ледника растаяла, и он стал короче почти на 1350 м; примерно на 450 м укоротился за 50 лет Аккемский ледник. Особенно интенсивное отступание ледников происходит в горах Юго-Восточного Алтая, где Большой Талдуринский ледник за 55 лет отступил почти на 1250 м, а Алахинский — на 1200 м.