Біологічні каталізатори - ферменти здатні працювати тільки в певних межах рН, а при виході за ці межі їх активність може різко знижуватися. Наприклад, активність ферменту пепсину, який каталізує гідроліз білків і сприяє таким чином перетравлення білкової їжі в шлунку, максимальна при значеннях рН близько 2. Тому для нормального травлення необхідно, щоб шлунковий сік мав досить низькі значення рН: в нормі 1,53-1,67. Визначення водневого показника крові є рутинною процедурою в клінічній діагностиці. У нормі pH плазми крові становить 7,4, зниження цього показника називається ацидозом і може спостерігатись, наприклад, при важких формах цукрового діабету. Під час інших захворювань кров може навпаки ставати надто лужною, такий стан називається алкалозом. Кишечник пристінкова мікрофлора кишечника перешкоджає проникності через слизову оболонку хвороботворних мікробів. Її антибактеріальна активність створюється за рахунок синтезу органічних кислот, в результаті чого кислотність (рН) навколишнього середовища падає до значень 4,0-3,8. Така низька кислотність гальмує ріст і розмноження хвороботворних і гнильних мікроорганізмів, які відчувають себе чудово в лужному середовищі, що виникає при гнитті і бродінні в кишковому тракті.
