Среди китайского крестьянства большим влиянием пользовались тайные общества, в частности «Ихэтуань» (отряды мира и справедливости»). Его социальный состав был пестрым. Преобладали крестьяне, но было и немало разорившихся ремесленников, кули, солдат, чиновников, шэныни. Организации общества «Ихэтуань» начали превращаться в центры, возглавлявшие стихийные выступления крестьянства и др. слоев населения против иностранных колонизаторов. Ареной деятельности общества стала провинция Шаньдун. Общество выдвинуло лозунг: «Поддержим Цинов, смерть иностранцам!». Их призывы находили всеобщую поддержку среди населения. В 1898 г. общество, раньше действовавшее в глубоком подполье, начинает открытую пропаганду. По его призыву формируются вооруженные отряды. С начала 1899 г. ихэтуани стали контролировать значительную часть провинции Шаньдун. Ненависть к колонизаторам проявлялась в разгроме христианских церквей, выступлениях не только против иностранных миссионеров, но и против китайцев, принявших христианство. Маньчжурская знать и китайские феодалы боялись расширявшегося стихийного выступления масс. Но та часть маньчжурской знати и китайских феодалов, которая выступала против всего иностранного с консервативных, феодальных позиций, надеялась использовать ихэтуаней в своих интересах. Губернатор Шаньдуна Юй Сянь вступил с ними в переговоры и согласился включить ихэтуаней в сельское ополчение.
Вожди ихэтуаней проводили в тот период по отношению к иностранцам тактику «устрашения», требовали их ухода из Китая, но воздерживались от открытых нападений. В конце 1899 г. по требованию американского посланника Юй Сянь был смещен с поста губернатора. Новый губернатор, Юань Шикай, двинул против ихэтуаней войска, которые вместе с находившимися в Цзяочжоу немецкими солдатами усмиряли население. В декабре 1899 г. на совещании посланников иностранных государств было выработано совместное требование китайскому правительству жестоко расправиться с участниками движения ихэтуаней. В марте 1900 г. империалистические державы потребовали от китайского правительства усиления репрессий, открыто угрожая военным вмешательством. В апреле в Дагу прибыли военные корабли Англии, США и других: империалистических держав.
Действия Юань Шикая и открытое вмешательство колонизаторов вызвали новый подъем народного движения. Весной 1900 г. антиимпериалистическое восстание охватило столичную провинцию Чжили. Отряды ихэтуаней направились к столице. К маю движение охватило не только сельские местности, но и города, приближались к Пекину. Тысячи солдат правительственных войск переходили на сторону повстанцев. Вооруженные выступления ихэтуаней охватили Маньчжурию. Их прокламации распространялись в Центральном и Южном Китае. Положение цинского правительства стало угрожающим. В правящем лагере не было единства. Цыси пригласила на аудиенцию вождей ихэтуаней. В июне 1900 г. несколько десятков тысяч повстанцев вступили в Пекин и Тяньцзинь. Правительство лицемерно заявило, что берет их под свое покровительство. Капиталистические державы, перешли к военным действиям. Их войска после бомбардировки с моря заняли форты Дагу и повели наступление на Тяньцзинь. Цыси подписала 21 июня указ об объявлении войны державам. Отряды ихэтуаней осадили посольства. Германский посланник и советник японского посольства были убиты. Началось 56-дневное «пекинское сидение» иностранных дипломатов. В подавлении восстания ихэтуаней участвовали войска восьми государств: Германии, Японии, Англ., США, России, Фр., Италии и А-В. Командующим объединенной армией карателей был назначен германский фельдмаршал Вальдерзее. Отряды ихэтуаней оказали сопротивление. На стороне повстанцев сражались некоторые части правительственных войск. Бои в окрестностях Тяньцзиня продолжались около месяца. Только 14 июля интервентам удалось полностью овладеть городом. Правительство эвакуировалось из Пекина в Сиань. Оно потребовало прекратить осаду иностранных посольств и поручило Ли Хунчжану вступить в переговоры с иностранными державами. 15 августа пал Пекин. Цыси, полностью капитулировав, приказала правительственным войскам присоединиться к интервентам и вместе с ними истреблять повстанцев. После занятия Пекина Вальдерзее послал карательные экспедиции в различные районы Северного Китая. Подавив восстание, иностранные колонизаторы навязали Китаю новый неравноправный договор. 7 сентября 1901 г. Ли Хун-чжан и посланники восьми держав подписали «Заключительный протокол», устанавливавший, что Китай обязан в течение 39 лет выплатить державам огромную контрибуцию — 450 млн. лян серебра, а с учетом процентов — около 1 млрд. лян. В Пекине создавался особый посольский квартал, где каждое посольство могло иметь свою вооруженную охрану с пулеметами и орудиями. Иностранцы получили право держать в Китае свои войска и флот. «Заключительный протокол» обязывал китайское правительство наказывать смертной казнью за антииностранные выступления