В основе процесса синтеза АТФ лежит реакция окислительного фосфорилирования аденозиндифасфата (АДФ) в присутствии неорганического фосфата (Фн) в сопряжении с реакцией биологического окисления в митохондриальной мембране. Сущность этого процесса заключается в том, что образование АТФ сопряжено с переносом Н+ и электронов в митохондриальной мембране. Главнымферментом на этой последней стадии процесса является аденозинтрифосфатаза (Н+ -АТФаза). Высвобождающаяся при этом свободная энергия не может быть полностью использована организмом. Около 50% её рассеивается в организме в виде тепла. Другая часть энергии окисления субстрата преобразуется в «макроэргетические» соединения, из которых важнейшим в количественном плане является АТФ (аденозинтрифосфат). Этот процесс получил название окислительного фосфорилирования. АТФ играет центральную роль в клеточном метаболизме. АТФ обеспечивает основную долю химической энергии, которая может быть использована для выполнения химической, осмотической и механической работы. Все формы жизни используют АТФ как фундаментальную единицу биомеханической энергии. Процесс окислительного фосфорилирования протекает в митохондриях. Внутренняя митохондриальная мембрана содержит компоненты дыхательной системы и АТФ-синтазу, учавствующую в образовании АТФ. Поэтому 90% кислорода, потребляемого организмом, метаболизируется внутри митохондрий. Окисление субстратов, в случае аэробных условий, свидетельствует, что оно возможно и в анаэробных условиях, когда в тканях имеет место дефицит кислорода. В этом случае конечным акцептором водорода будет не свободный кислород, а кислород при двойной связи какого-либо соединения, например, пировиноградной кислоты.