1)гіпотеза гастреї Е.Геккеля (1874)
Він стверджував, що віддаленим предком багатоклітинних була кулеподібна колонія джгутикових одноклітинних.
Стадії утворення: Амебоїдні цистеї→бластеї(колонії)→гастрея.
Подібну будову до гастреї мають кишковопорожнинні, від яких на думку Геккеля, виникли всі інші багатоклітинні.
2)гіпотеза фагоцителли Мєчнікова (1886)
Вважав, що багатоклітинні розвивалися з колоні джгутикових. Однак утворення внутрішнього шару відбулося не шляхом впинання зовнішнього шару, а внаслідок заповзання окремих клітин стінки колонії в її порожнину. Цей процес був повазаний з внутріклітинним травленням (фагоцитозом), тому і предок називають фагоцителою, від якої походять губки та кишковопорожнинні.
3) гіпотеза А.В. Іванова, який припускає, що від тих нащадків фагоцители, які перейшли до сидячого способу життя, походять губки. Процес перетворення – еміграція, предок двошаровий без рота.
4)гіпотеза Хаджи: багатоклітинні тварини походять від багатоядерних інфузорій, ядро розпадається, навколо ядер формується цитоплазма – процес целюмерації, на його думку так виникли – війчасті (плоскі) черви.