В эксперементах (с1875г.) доказал, что спирт. брожение вызывается определенными видами микроорг., а скисание вина связано с попадением в виноград. сок посторонних видов, вызывающ. уксусно-кислое брожение. Для борьбы с ними он предложил метод термич. обработки виноградн. сока, так же изучал процессы гниения, развитие промышленной микробиологии. Изучал роль микроорг. в круговороте вещ-в в природе, открыл анаэробн. микроорг., разработал принципы асептики, методы стерилизации, методы получение вакцины, открыл вакцины против куриной холеры, против бешенства. Является основоположником микробиологии как фундаментальной науки.