В основі вченні Спінози про природу, лежить вчення про субстанцію, яку він ототожнює з Богом, тобто з природою. Під субстанцією Спіноза розуміє те, "... Що існує саме по собі і є само через себе.". Згідно з цим вченням сутність субстанції складається з складових, які називаються атрибутами. Богу, тобто природі, властиво нескінченне число атрибутів, але наше пізнання зводиться до двох з цього нескінченного числа атрибутам. Перший з них визначає тілесну субстанцію - це атрибут протяжності. Спіноза тлумачить протяжність у фізичному сенсі, як заперечення порожнечі. Однак субстанція, згідно Спіноза, не зводиться до протяжної матерії, тому що їй притаманний ще й атрибут мислення. У цьому головна відмінність вчення Спінози від вчення Декарта, який поділяв дві абсолютно різні субстанції - протяг і мислення, зв'язок між якими відбувалася вищою істотою (Богом), що стоять поза обох цих субстанцій. Декарт, при всьому раціоналізмі, залишився на позиціях релігії в цьому вирішальному пункті, так як у нього збереглося поняття про Бога як про особистий істоту, незалежному від природи та чинним з вільної волі. У Спінози ж субстанція, що має два основних атрибуту протяг і мислення, ототожнюється з Богом. І тим самим, Спіноза заперечує існування Бога як конкретної особистості. Таким чином, існує тільки одна субстанція, яка є Бог. Дана субстанція - Бог: вільна, бо існує і діє за своїми законами; вічна, тому що існування полягає в її суті і є єдино існуючої субстанцією.
Субстанції повинні бути притаманні основні, що визначають її властивості - атрибути (складові її сутність). Субстанція (Бог), будучи нескінченною, виражається і проявляє свою сутність у нескінченній множині форм і образів, або атрибутів. Оскільки атрибути є формою прояву субстанції, то їх незліченна кількість вичерпує сутність субстанції, бо ми не можемо уявити собі, що є атрибути і ще щось. Кожен з атрибутів висловлюючи нескінченність божественної субстанції, повинен сприйматися сам по собі, інакше кажучи, один без допомоги іншого.
Спіноза стверджує, що, незважаючи на існування незліченної безлічі атрибутів, нам відомі тільки два: "мислення" і "протяжність" - саме ці дві створені субстанції, визнані Декартом, Спіноза зводить до атрибутів. Якщо у Декарта протяг і мислення - атрибути двох самостійних субстанцій, взаємодія між якими встановлюється Богом, то у Спінози це два атрибути однієї субстанції - Бога. Ці атрибути абсолютно незалежні, тобто не можуть впливати один на одного.
Протяг складає одне з властивостей нескінченної субстанції, тому що без цієї властивості не можна мислити собі жодної кінцевої речі. Воно є визначальною ознакою тіла. Протяг саме по собі неподільне, подільність - "видимість" кінцевих речей. Слідом за Декартом Спіноза заперечує і існування пустоти.
Однак субстанція не зводиться до протягу - їй притаманний ще один атрибут - мислення. Терміном "мислення" Спіноза позначає весь зміст людської свідомості, у тому числі і власне розум, тобто здатність до логічних висновків. Нескінченний розум оголошується Спінозою одним з нескінченних модусів. Єдина властивість нескінченного розуму полягає в тому, щоб розуміти завжди все ясно і чітко. Так як мислення є атрибутом субстанції, то й кожна модифікація останньої, тобто кожна річ, може бути представлена через нього. Крім того, теоретично гідності атрибутів рівні, однак "мислення", здатність думати самостійно, повинно було б відрізнятися від всіх інших атрибутів, бути привілейованим. Але це б викликало безліч внутрішніх труднощів і змусило б ввести ієрархію, іншими словами, вертикальний порядок, в той час як Спіноза прагнув до горизонтального порядку, тобто до повного рівноправності атрибутів.
Крім субстанції і атрибутів існують модуси. Спіноза дає наступне визначення: "Під модусом я розумію стан субстанції, тобто щось, що міститься в іншому, через яке і представляється ". Без субстанції, і її атрибутів не було б модусів, а ми не змогли б їх сприймати. Точніше, слід було б сказати, що модуси випливають з атрибутів і являють собою визначення атрибутів: "Кожен модус, що володіє необхідним і нескінченним існуванням, необхідно повинен випливати з абсолютної природи будь-якого атрибуту Бога, або з будь-якого атрибуту, що знаходиться в стані необхідної і нескінченної модифікації ".
У структурі субстанції у Спінози можна побачити різні модуси, одні з них - нескінченні модуси, інші - кінцеві модуси, також є складні модуси. Однак Спіноза не переходить безпосередньо від нескінченних атрибутів до кінцевих модус, а запроваджує нескінченні модуси, які знаходяться посередині між атрибутами, нескінченними за своєю природою, і кінцевими модусу. Наприклад, нескінченний модус нескінченного атрибуту мислення - нескінченний розум і нескінченна воля, кінцевим модусом атрибуту мислення є думка. Нескінченні модуси нескінченного атрибуту протяжності - рух і стан спокою, кінцевий модус атрибуту протяжності - рух певного предмета. Нескінченним модусом є також світ, який хоча і змінюється в деталях, але в цілому залишається тим же самим.
Як же намагається Спіноза пояснити проблему переходу від нескінченного до кінцевого, тобто від нескінченних модусів до кінцевих модусів. Спіноза відразу вводить ряд модусів і приватних модифікацій і просто говорить, що одні походять з інших.
Модус, відповідний природі нескінченного атрибуту Бога, також нескінченний, інше ж пов'язано з кінцевою модифікацією і має певне існування. Бог, або субстанція, є причиною самого себе, а також причиною нескінченного атрибута і нескінченного модусу. Нескінченне породжує тільки нескінченне, а кінцеве породжене кінцевим, неможливо вивести з нескінченного модусу кінцевий модус. Однак, яким же чином у рамках нескінченної божественної субстанції нескінченні атрибути перетворюються в кінцеві модуси, як народжується кінцеве Спіноза залишає без пояснення. Для Спінози будь-яке визначення є запереченням, і абсолютна субстанція, абсолютно позитивне істота, така, що не підлягає визначенню, тобто запереченню. Отже, ми бачимо, що у Спінози, як і у Декарта, виникає дуалізм, в даному випадку - це відносини кінцевого і нескінченного. Світ кінцевих модусів і одиничних речей існує відокремлено від нескінченної субстанції з її нескінченними атрибутами, тобто причинний ланцюг кінцевих модусів складає окремий світ і ніякого підпорядкування нескінченного над кінцевим немає.
Пантеїзм Спінози є важливим поняттям, яке завершує його вчення, про єдину субстанції. На підставі вище розглянутих питань можна зробити висновок, що під Богом Спіноза розуміє субстанцію з її нескінченними атрибутами; світ, навпаки, складається з модусів - нескінченних і кінцевих. Однак, одні без інших існувати не можуть, все неминуче має причинно-наслідковий зв'язок з природою Бога, нічого не існує випадково і світ є необхідним наслідком Бога.
Слід зауважити, що поняття природи по Спінозі розуміється інакше, ніж декартівської природа, обмежена двома субстанціями. Бо Спіноза показує, що Бог здійснюється в природі (за допомогою атрибутів і модусів), природа ж - це і є прояв форм Бога. Також можна зробити висновок, що деяка частина Бога присутній в кожній речі. Відбувається єдність природи Бога і сутності. Так як прояв Бога відбувається через незліченну кількість атрибутів і модусів, то, отже, ці нескінченні прояви вичерпують Бога, і це означає, що всі речі вже створені.
Далі розглянемо поняття природа. У вченні Спінози це поняття поділяється на "природу породжує" і "природу породжену". Породжує природа - це причина, а породжена природа - наслідок цієї причини. Таким чином, ми бачимо, що є дві абсолютно різні природи: породжує і породила.
Породжує природа - Бог, який існує сам через себе (тобто причина самого себе) і сам у собі, як прояв в атрибутах. Бог є також вільна причина, тому як діє за законами своєї природи без чийогось примусу. А так як все випливає з необхідності божественної природи, Бог є іманентна причина речей.
Породжена природа - світ, який випливає з необхідності природи Бога і атрибутів, тобто світ випливає із зовнішнього і по необхідності природи Бога. Світ є породжена природа.
Отже, пантеїзм Спінози полягає в тому, що Бог проявляє себе у всьому (в кожній речі) і присутній в усьому, діє як іманентна причина, не будучи зовнішнім по відношенню до всього світу. І оскільки нічого поза Бога не існує, тому що все знаходиться в ньому, то концепцію єдиної субстанції Спінози можна назвати пантеїстичної.
Також ми можемо зрозуміти, чому Спіноза не приписував Богу розум, волю і любов. Бог - є субстанція, в той час як розум, воля і любов є модусами атрибуту мислення. Як було сказано вище, атрибути є проявами, а модуси - станами прояви субстанції. Звідси випливає, що модуси - нескінченні або кінцеві - належать до породженої природі - світу, причиною якої є субстанція - Бог. Отже, Бог є причиною і, як було сказано вище, іманентної причиною, а модуси є тільки наслідками цієї причини, тобто розум, любов і т.д. є тільки наслідками цієї причини. Не можна сказати, що Бог задумав створення світу розумом, що він бажав його створення в результаті вільного вибору або створив його з любові, бо все це апостеріорного Бога і від нього відбувається. І приписувати ці властивості Бога означало б плутати породжує природу з породженою.
Тепер стає зрозуміло, чому пантеїзм Спінози протягом століть викликав полеміку мислителів різних рангів, які оскаржували і спростовували його ідеї.
