Яґеллонський Університет є найстарішою науковою установою Польщі, його існування було безперервним, незважаючи на всі політичні потрясіння, яких зазнавала Польща Їх найбільш видатними представниками були: Marcin Krol of Zurawica(1422 – 1460), Marcin Bylica of Olkusz (1433 – 1493), який згодом став головним астрологом короля Matthias Corvinus in Buda; Marcin Biem (1470 – 1540), який розробив реформи юліанського календаря, Jan of Glogow (1445 – 1507), автор численних математичних і астрономічних трактатів, відомих по всій Європі; Wojciech of Brudzewo (1446 – 1495), котрий став наставником для багатьох студентів, які, в свою чергу, стали провідними вченими в інших європейських університетах.
У 1848 році Краків увійшов до складу Австрійської імперії. Це був початок нового золотого століття для університету, який було перейменовано в Ягелонський університет у 1817 році. Університет знову стає великим науковим центром. Тогочасна історія університету славиться науковими досягненнями таких вчених як: хімік Karol Olszewski (1846 – 1915), фізик Zygmunt Wroblewski (1845 – 1888), які були першими, хто добув кисень та азот з повітря в 1883 році, а пізніше також інших газів; фізіолог Napoleon. Історія університетської освіти : виникнення, становлення, розвиток 160 Cybulski (1854 – 1919), який пояснив функціонування адреналіну; фізик Marian Smoluchowski (1872 – 1917), автор праць з кінетичної теорії матерії; хімік Leon Marchlewski (1869 – 1946), який проводив дослідження з хлорофілу; Paulin Kazimierz Zurawski (1866 – 1953) і Stanislaw Zaremba (1863 – 1942), чиї видатні дослідження дали старт для створення математичної школи. Їхня робота отримала подальший розвиток завдяки їхнім учням. Велика депресія у 1930 – 1934 роки завдала серйозного фінансового удару по молодій польській державі, що призвело до різкого скорочення витрат на освіту. Тим не менш, незважаючи на труднощі, Яґеллонському університету вдається зберегти свою високу академічну репутацію. Професор Tadeusz Banachiewicz (1882 – 1954), математик, астроном і геодезист, розробив новий метод математичного розрахунку, відомий як Краківський розрахунок. Краківська школа лінгвістики може похвалитись такими видатними вченими, як: Jan Rozwadowski (1867 – 1935), Jan los (1860 – 1928). Іва́н Павло́ІІ (лат. Ioannes Paulus PP. II, пол. Jan Paweł II, італ. Giovanni Paolo II; мирське ім'я: Ка́роль Войти́ла, пол. Karol Józef Wojtyła) (* 18 травня 1920, Вадовіце, Польща – † 2 квітня 2005, Ватикан) – Блаженний Католицької Церкви, 264-й Папа Римський, перший в історії Папа-слов'янин, 6-й суверенний голова міста-держави Ватикан, римо-католицький польський єпископ, єпископ-помічник Кракова, а пізніше архієпископ-митрополит Краківський і кавалер Ордену Білого Орла.
Микола́й Копе́рник – польський астроном і математик, автор геліоцентричної теорії побудови Сонячної системи. до заслуг Коперника в цей час належать проектування і будівництво гідравлічної машини у Фромборку, що постачала в будинки воду, а також запуск польського монетного двору. Крім того, М.Коперник вів постійну лікарську практику, зокрема боровся з епідемією 1519 року. М.Коперник – славетний учений. Міжнародний союз чистої та прикладної хімії (IUPAC) затвердив, запропоновану в липні 2009 року співробітниками німецького Інституту важких іонів в Дармштадті, офіційну назву для 112-го елемента таблиці Менделєєва – коперніцій ). На Місяці на честь М.Коперника названо кратер. Крім того, ім'ям вченого названо астероїд головного поясу 1322 Коперник. Монументи М.Копернику встановлено у Варшаві, Кракові, Торуні, Реґенсбурзі, Ольштині, Вроцлаві тощо. Ім'я Миколи Коперника має Торунський університет (відкритий у 1945 році). У Торуні та Фромборку діють музеї М.Коперника [2, с. 391].
Багато видатних людей, які прославилися у різних галузях науки і мистецтва, у свій час навчалися в Яґеллонському університеті. Норман Девіс – британський історик, Кшиштоф Зануссі – кінорежисер, Іоанн Павло II – папа римський, Януш Кшиштоф Козловський – археолог, дослідник стародавньої історії Європи, Микола Коперник – Випуск 2. Історія університетської освіти : виникнення, становлення, розвиток 162 астроном, математик і економіст, автор геліоцентричної системи світу, Станіслав Лем – письменник-фантаст, Ян III Собеський – король Польщі, Віслава Шимборська – поетеса, лауреат Нобелівської премії з літератури, Єжи Штур – актор і режисер. Цей перелік можна ще довго продовжувати, але зрозуміло одне, що така плеяда талановитих людей, вихованців Краківського університету, беззаперечно підвищує авторитет закладу та вказує на його високий рівень організації навчання.
