В настоящее время все микроорганизмы делят на 3 царства:
1. Procariotae. К данному царству можно отнести все виды бактерий, риккетсий, хламидий, микоплазм и т.д. В клетках есть ядро с одной хромосомой. Ядро не отделено от цитоплазмы клетки. Простой цикл деления путем перетяжки. Есть ряд уникальных органелл, таких как плазмиды, мезосомы. Отсутствует способность к фотосинтезу.
2. Eucariotae. Представителями данного царства являются грибы и простейшие. Клетка содержит ядро, отграниченное от цитоплазмы мембраной, с несколькими хромасомами. Есть ряд органелл, характерных для высших животных: митохондрии, эндоплазматическую сеть, аппарат Гольджи. Некоторые представители данного царства имеют хлоропласты и способны к фотосинтезу. Обладают сложным жизненным циклом.
3. Vira. К данному царству относятся вирусы. Отличительными чертами вириона является наличие только одного типа нуклеиновых кислот: РНК или ДНК, заключенного в капсид. Общей внешней оболочки у вируса может не быть. Размножение вируса может происходить только после встраивания в другую клетку, где и происходит репликация.
В связи с различиями в строении клеточной стенки все бактерии делятся на 4 отдела:
- грациликуты - бактерии с тонкой клеточной стенкой, грамотрицательные (к ним относятся различные извитые, палочковидные, кокковые формы бактерий, а также риккетсии и хламидии);
- фирмикуты - бактерии с толстой клеточной стенкой, грамположительные (к ним относятся палочковидные, кокковые формы бактерий, а также актиномицеты, коринебактерии и микобактерии);
- тенерикуты – бактерии без клеточной стенки, имеющие трехслойную цитоплазматическую мембрану (микоплазмы);
- мендозикуты – археи (экстремальлные бактерии), отличающиеся дефектной клеточной стенкой, особенностями строения рибосом, мембран и рибосомальных РНК. Эта группа бактерий не обладает патогенными свойствами и не имеет значения для ветеринарии.