В настоящее время в республике насчитывается 97 особо охраняемые природные территории (ООПТ) площадью свыше 100 тыс. га, или 6 % от всей площади республики. В республике функционируют 3 особо охраняемые природные территории федерального значения: Государственный природный заповедник «Присурский» (9,15 тыс. га) , Национальный парк «Чаваш вармане» (25,2 тыс. га) , Чебоксарский филиал Главного ботанического сада РАН (177 га, коллекции растений более 2 тыс. видов) и 94 ООПТ и объектов республиканского значения, в т. ч. 67 памятников природы, 8 государственных природных заказников, 5 госохотзаказника, 1 дендрологический парк, 1 заповедно-охотничье хозяйство, 4 округа санитарной охраны, 5 лесных генетических резерватов.
Прису́рский запове́дник — государственный природный заповедник, расположенный на территории Чувашской Республики. Заповедник состоит из 3-х участков (с 2000), расположенных в трёх разных районах республики. Присурский государственный природный заповедник учреждён 27 декабря 1995 года. Его общая площадь 9 150,4 га.
Количество кластеров 3. Площадь охранной зоны составляет 25 497,5 га. Основная часть заповедника расположена в долине Суры на территории Алатырского района (9025 га), в основном занята хвойно-широколиственными лесами. В Батыревском (27,6 га) и Яльчикском (97,8 га) районах участки расположены в степи, на которых сохранились степные сурки — байбаки. Батыревский участок организован на базе бывшего суркового заказника республиканского значения (он был организован в 1961 году и имел площадь 25 га, а сменивший его заповедник — 27 га), Яльчикский — заказника местного значения .
Климат района умеренно-континентальный. Средняя годовая температура воздуха +3…+3,5 С. Годовое количество осадков составляет от 450 до 750 мм. В Присурском заповеднике (в его охранной зоне) располагается памятники природы республиканского значения («Речка Люля», «Группа озёр Старая Старица», «Группа озёр Старица, Базарское») и археологический памятник «Заячий городок» эпохи ранней бронзы (2 тыс. лет до н. э., Чирковская культура).
Растительную основу составляют, произрастающие здесь ель, сосна, береза и осина. В водоёмах растёт такой редкий вид как плавающий водяной орех, занесенный вКрасную книгу России, также туда занесены такие редкие виды, растущие на территории заповедника, как прострел раскрытый, грушанка круглолистная, касатик водный, щитовник австрийский, гроздовник многораздельный. На Яльчикском участке (около деревни Суринское) встречаются элементы луговой степи, в том числе,ковыль волосовидный, овсяница бороздчатая, тимофеевка степная, шалфей мутовчатый и степной, астрагал австрийский и датский, оносма простейшая, колокольчик волжский.
Из животных встречаются лось, кабан, заяц-беляк, бобр, рыжая полевка, лесная соня, лесная куница, волк, рысь, бурый медведь. Степные сурки (байбаки) сохранились на Батыревском и Яльчикском участках. Ещё два элемента степной фауны это степная пеструшка и крапчатый суслик. Из птиц отмечены филин, сова-сплюшка, глухарь, тетерев и малая чайка. Из редких видов представлены черная, белокрылая, речная и малая крачки, малый зуек, кулик-сорока, серый журавль, скопа,могильник и змееяд.
Всего на его территории встречаются около 1000 видов растений (покрытосеменные — 800 видов, голосеменные − 5, папортниковидные — 14, плауновидные — 3, мхи — 127, лишайники — 70) и 120 видов грибов[7][8].
Всего на территории заповедника зарегистрировано 190 видов птиц (13 из них включены в Красную книгу России). Млекопитающих — 46 видов, рыбы — 33, земноводные — 9, пресмыкающиеся — 7. Обнаружено более 1500 видов насекомых, включая редкие как отшельник обыкновенный, слоник острокрылый (жуки);аполлон обыкновенный, мнемозина (бабочки); пчела-плотник, парнопес крупный (перепончатокрылые), муравей-древоточец пахучий[10].
Основной охраняемый вид — выхухоль.
Национальный парк «Чаваш Вармане» (чуваш. Чăваш Вăрманĕ) был создан в 1993 году на территорииШемуршинского района Чувашской Республики для сохранения местного природного комплекса. Образован 20 июня 1993 года Постановлением Правительства РФ № 588 «Об образовании национального парка „Чаваш вармане“ Федеральной службы лесного хозяйства России». В 2011 году награждён дипломом победителя конкурса «Семь чудес Чувашии» в номинации «Чудо природы».
· Общая площадь — 25200 гектаров
· Протяжённость с севера на юг — 24 км
· Протяжённость с запада на восток — 17 км
· Леса занимают 95 % территории (доля сосновых насаждений составляет 45,3 %, березовых — 27,1 %, осиновых — 14,6 %, липовых — 7,4 % , ольховых — 2,4 %, еловых — 1,4 % , дубовых — 1,6 %, кедровых, ясеневых, кленовых и ивовых — 0,2 %).
· Произрастает около 800 видов растений, выявлено 57 видов растений, включенных в Красную книгу Чувашской Республики.
· Обитают 44 вида млекопитающих.
· Обитают 184 вида птиц.
· Обитают 6 видов пресмыкающихся.
· Обитают 11 видов земноводных.
· Обитают 19 видов рыб.
11 видов птиц, 1 млекопитающее и 3 вида насекомых, отмеченных на территории национального парка, включены в Красную книгу Российской Федерации
Птицы:беркут, большой кроншнеп,большой подолик, змееяд,кулик-сорока, черный аист, филин и т.д.
