Экологический атлас представляет собой систему карт, органически взаимосвязанных и дополняющих друг друга, построенную в соответствии с назначением атласа и особенностями его использования; включает самые разнообразные карты экологической тематики.
Примеры: НАР (Второй том "Экология"), Экологический атлас России, Экологический атлас Арктики
Структура атласа определяется его назначением и типом, особенностями природы территории, степенью ее изученности и антропогенной трансформации, информационным обеспечением.
По тематике и степени интеграции информации экологические атласы можно разделить на комплексные и отраслевые.
Комплексные атласы характеризуют экологическую ситуацию в целом, к ним относится большинство региональных атласов.
В отраслевых при наличии общей характеристики экологической ситуации особое внимание уделяется определенному ее аспекту («Окружающая среда и здоровье населения России», «Туберкулез и окружающая среда Саратовской области», «Эколого-экономический атлас Республики Татарстан») либо оценке воздействия отдельной отрасли
По масштабу и территориальному охвату
- Общенациональные — масштаб мельче 1:10 000 000; «Экологический атлас России» 2002 г. геогр фак МГУ, Институт географии РАН, Всероссийского научно-исследовательского информационного центра по лесным ресурсам, Института географии СПбГУ и тд. Атлас включает 68 основных карт и 32 дополнительных в виде карт-врезок и анаморфоз. Основные карты составлены в масштабах 1:20 000 000, 1:30 000 000, 37 000 000; дополнительные — в масштабах 1:6 000 000, 1:6 500 000, 1:8 000 000 и 1:13 000 000. Атлас состоит из шести разделов: 1) условия формирования экологической обстановки; 2) антропогенные воздействия на природную среду; 3) изменения природной среды; 4) экологическое состояние природной среды; 5 медико-экологическая обстановка; 6) экологическая обстановка и охрана природы
- В региональных атласах обычно рассматривается отдельный субъект федерации (реже — их сочетание), поэтому масштаб определяется площадью территории. Так, для «Эколого-географического атласа Карачаево-Черкесской Республики» (2001) использовался масштаб 1:560 000, а для «Экологического атласа Ростовской области» (2000)
