Основными причинами, тормозящими широкое применение ИФА-метода, являются недостаточное количество лабораторий, оснащенных специальным оборудованием на местах, отсутствие недорогих высококачественных отечественных иммуноферментных наборов реагентов, а также проблема хранения и транспортировки в замороженном виде отобранных в хозяйстве проб молока в диагностические лаборатории, часто находящиеся на значительном расстоянии от самой фермы.