Окончание миссии консула может иметь место в следующих случаях:
1) отозвание консула представляемым государством;
2) аннулирование экзекватуры государством пребывания;
3) истечение срока консульского патента;
4) закрытие консульского учреждения в данном пункте;
5) прекращение консульских отношений в целом;
6) война между государством пребывания и представляемым государством;
7) смерть консула;
8) выход территории, где находится консульский округ, из-под суверенитета государства пребывания.
Отозвание консула представляемым государством наиболее распространено и в основном имеет место при нормальной смене консулов в каком-либо пункте государства пребывания. При этом государство пребывания извещается заблаговременно о факте отозвания консула, а для его преемника испрашивается экзекватура.
Аннулирование экзекватуры происходит гораздо реже, как правило, в результате нарушения консулом законов государства пребывания. При этом, согласно ст. 23 Венской конвенции о консульских сношениях 1963 г., консул может быть объявлен persona non grata (нежелательным лицом) и перед представляемым государством может быть поставлен вопрос о его отзыве. Государство пребывания в этом случае не обязано мотивировать причины аннулирования экзекватуры.
В случае войны прекращающий свою миссию консул может поручить защиту интересов своих соотечественников в государстве пребывания консулу третьего государства.