1)формирование атипичных штаммов, которые затрудняют диагностику;
2) образование L-форм. не выявляемых обычными методами и малочувствительных к антимикробным воздействиям, способных к длительной персистенции в организме (происходит хронизация инфекции, возникают рецидивы);
3) формирование и распространение лекарственной устойчивости