В 1945 упраздняется ГКО, функции которого передаются СНК (Совет народных комиссаров) СССР.
Был ликвидирован также ряд отделов исполкомов местных Советов.
В марте 1946 г. СНК СССР и СНК республик были преобразованы в Советы министров СССР и Советы Министров соответствующих республик, а наркоматы - в министерства.
К началу 50-х гг. в связи с расширением масштабов производства и усложнением хозяйственных связей народа командно-административная система начала входить в противоречие с реальными отношениями.
Прежде всего, неэффективность системы начала проявляться в управлении хозяйством.
При этом нельзя не учитывать политические процессы, связанные со смертью Сталина (5 марта 1953 г.).
На совместном заседании Пленума ЦК, Совета Министров и Президиума Верховного Совета было принято решение об изменениях в руководстве страной.
Совет Министров возглавил Г.М. Маленков.
Министерство внутренних дел и Министерство государственной безопасности сливались, руководителем был избран Берия.
Министром вооруженных сил стал НА. Булганин,
Министром иностранных дел оставался В.М. Молотов,
Председателем Президиума Верховного Совета — К.Е. Ворошилов.
Март 1953 — февраль 1955 гг. определяется как период «коллективного руководства».
В сентябре 1953 г. Н.С. Хрущев был избран на пост Первого секретаря ЦК КПСС, что значительно усилило его властные позиции.
В 1954 г. были произведены изменения в организационной структуре министерств и произведено сокращение управленческих штатов.
В 1957 г. отраслевая структура управления заменяется территориальной, что выражалось в ликвидации министерств и создании Советов народного хозяйства областей и экономических районов.
В начале 60-х гг. были образованы республиканские совнархозы, а затем и Совет народного хозяйства СССР (1963).
Одновременно создавались отраслевые государственные комитеты.
Это привело к еще большим трудностям в управлении из-за многоступенчатости системы и пересечения функций ее отдельных звеньев.
В итоге после смещения Н.С. Хрущева (1964) был осуществлен возврат к отраслевой структуре управления хозяйством (1965), т.е. произошла регенерация (восстановление) командно-административной системы.