Комитет министров. Его компетенция сложилась исторически и состояла из чрезвычайно разнородных групп вопросов, большая часть из которых была мелочными и маловажными. Формально, компетенция Комитета состояла из двух видов дел: Текущие дела по министерскому управлению; Дела, в особенности присвоенные Комитету министров законом. Данные нормы носили весьма общий характер, и реальный перечень дел, рассматриваемых Комитетом, складывался хаотично; только в 1905 году была сделана первая попытка систематизировать предметы ведения Комитета. Деятельность Комитета разделялась на три направления: важные межведомственные вопросы государственного управления; «одиозные» вопросы, которые формально находились в пределах ведения одного министерства, но за которых министры не хотели брать на себя персональную ответственность и стремились переложить её на коллегию; мелочные вопросы, список которых сформировался достаточно случайным образом. Наиболее важным предметом, который находился в ведении Комитета, были железнодорожные дела. Решения о предоставлении концессий для строительства железных дорог, учреждении железнодорожных компаний. Наиболее многочисленными были дела об индивидуальном назначении пенсии отставным чиновникам. Комитет рассматривал ежегодные отчеты губернаторов, генерал-губернаторов и отчет государственного контролёра по исполнению государственной росписи расходов и доходов.
Совет министров. совещательный орган по общегосударственным делам. Совет министров учреждался для «исключительного рассмотрения в Высочайшем присутствии Его величества» дел, требующих «общего соображения». Председателем Совета являлся сам император, который мог вносить на его рассмотрение любые вопросы. Рассмотрению в Совете подлежали: «виды и предположения к устройству и усовершенствованию разных частей, вверенных каждому Министерству и Главному управлению», первоначальные законодательные предположения с последующим внесением на рассмотрение Государственного.
