Световая микроскопия в вирусологии проводится с целью выявления крупных вирусов вирионов, внутриклеточных включений и патологических изменений клетки, пораженной вирусами. Из испытуемого вируссодержащего материала готовят мазки и препараты. Для световой микроскопии определяющее значение помимо разрешающей способности микроскопа имеет характер и направленность светового луча, а также особенности изучаемого объекта, который может быть прозрачным и непрозрачным. В зависимости от свойств объекта изменяются физические свойства света. И поэтому для световой микроскопии биологические объекты обычно окрашивают с целью выявления тех или иных их свойств. При этом ткани должны быть фиксированы, т.к. окраска выявляет определенные структуры только убитых клеток.
Люминесцентная микроскопия позволяет обнаружить даже небольшие концентрации вирусов в исследуемом материале. В люминесцентном микроскопе видны многие микроструктуры, неразличимые в обычном микроскопе, благодаря их природной флуоресценции или обработке особыми красителями - флуохромами. Это такие вещества которые обладают интенсивной флуоресценцией. Они широко используются в люминесцентной микроскопии для обработки биологических объектов, имеющих слабую собственную флуоресценцию.
Электронная микроскопия - это метод исследования структур, находящихся вне пределов видимости светового микроскопа и имеющих размеры менее одного микрона (от 1 мк до 1--5 A).Действие электронного микроскопа основано на использовании направленного потока электронов, который выполняет роль светового луча в световом микроскопе, а роль линз играют магниты. Позволяет непосредственно выявлять вирусные частицы, дифференцировать их по размеру, форме и ультраструктуре.
