Таможенные органы являются динамично развивающейся системой, однако с постоянным повышением требований к ее функционированию со стороны участников внешнеэкономической деятельности и всего мирового сообщества, заинтересованного в развитии международной торговли, становится недостаточным лишь управление текущими процессами, на первый план выходят вопросы управления развитием этой сложной системы.
Условия развития таможенных органов России требуют применения новых подходов и методов управления, таких как стратегическое управление и планирование, ориентация на потребителя, делегирование полномочий, маркетинг и бюджетирование, ориентированное на результат. Принципиальным вопросом остается способ внедрения таких приемов и методов в деятельность таможенных органов России для успешного развития и осуществления их полномочий. В целом, можно сделать вывод, что в настоящее время созрела объективная необходимость в постановке и решении задачи управления стратегическим развитием таможенных органов и именно поэтому необходимо использовать такой механизм, который в долгосрочной перспективе обеспечит результативное и стабильное функционирование в условиях макроэкономических угроз и повышающихся требований к безопасности государства.