Отдаленной гибридизацией называется такие скрещивания, когда подобранные пары принадлежат различным видам или родам, т.е. являются отдаленными не в географическом, а в родственном отношении. В соответствии с этим различают межвидовые (пшеница мягкая ? пшеница твердая) и межродовые (пшеница ? рожь) скрещивания. Отдаленной гибридизации принадлежит особая роль в эволюции и селекции. Под влиянием ее возникновения в естественных условиях и использования в практической деятельности процесс с выщеплением новых ранее не существовавших экземпляров, совмещающих признаки различных видов или родов за счет перекомбинаций наследственного материала и возникающих новообразований.
Первые опыты по отдаленной гибридизации растений были начаты в России в 1756 году И.Г. Кельрейтером, который опубликовал результаты исследований в 1772 году по скрещиванию виргинского и перувианского видов табака, от которых он получил гибриды, удачно сочетающие скороспелость, высокую урожайность и ценные качества табака обоих родителей. Из-за стерильности первого поколения созданные гибриды не нашли широкого применения, так как необходимо было ежегодно проводить такие скрещивания с целью получения гибридных семян для посева. С тех пор прошло уже более 240 лет, но интерес к получению новых растений с помощью отдаленной гибридизации, несмотря на то, что успехи от применения этого метода еще не многочисленные, не уменьшается, а значительно возрастает и приобретает все большие масштабы, усиливается его значимость.
Значение отдаленной гибридизации в создании нового исходного материала особенно велико на современном этапе селекционной работы, когда мы имеем выдающиеся успехи в деле создания весьма ценных сортов различных сельскохозяйственных культур.
Для дальнейшего прогресса в выведении новых сортов, обладающих комплексом биологических, хозяйственно-полезных и корреляционно связанных с ними морфологических признаков, очень часто возникает острая необходимость выйти за пределы вида для заимствования необходимых свойств от других видов. Например, создание иммунных сортов картофеля к фитофторозу, вирусным заболеваниям, раку, нематоде, колорадскому жуку за счет внутривидовой гибридизации практически невозможно, так как все многообразие сортов и форм культурного вида Solanum tuberosum не обладают устойчивостью к этим заболеваниям и вредителям. Но среди других видов рода картофеля такие формы имеются. К ним, прежде всего, относятся S.demissum, S.acaule, S.andigenum, S.vernei, S.maglea и другие.
За прошедший период, особенно в XX веке, по теории и практике отдаленной гибридизации накоплен богатый экспериментальный материал, выяснены неиспользованные возможности ее более широкого применения, определены объективные трудности ее осуществления, выявлены основные причины существующих генетических и других биологических барьеров, разработано ряд методов преодоления нескрещиваемости видов между собой и бесплодия первого поколения отдаленных гибридов.
Большой вклад в теорию и практику этого вопроса внесли такие ученые как И.В. Мичурин (методы преодоления нескрещиваемости плодово-ягодных культур), Г.Д. Карпеченко (плодовитые капустно-редечные гибриды), Н.В. Цицин (сорта пшенично-пырейных гибридов), А.Ф. Шулындин (первые сорта ржано-пшеничных амфидиплоидов) и другие.
При изучении исторического становления и эволюции (филогении) различных видов растений установлено, что в основе линий многих видов лежит естественная, спонтанная гибридизация между видами. Наиболее богатым и убедительным примером на этот счет может служить эволюция всего полиплоидного ряда пшеницы (рис. 7) и создание человеком новой зерновой культуры тритикале с различными уровнями плоидности (рис.8).