Реформирование высшего образования в республике наиболее интенсивно стало проводиться с 1995 года, но в то же время его темпы и глубина остаются недостаточными, а экономические трудности продолжают создавать основные препятствия в реализации необходимых преобразований.
За годы независимости Казахстана этапы реформирования системы высшего образования можно условно подразделить на следующие:
Первый этап (1991-1994 годы). Становление законодательной и нормативной правовой базы высшего образования.
11 марта 2010 года стал 47-ой страной, присоединившейся к Болонскому процессу. Сегодня вхождение республики в европейское образовательное пространство рассматривается в контексте национальных интересов в развитии внешнеполитического курса страны, направленного на сотрудничество с Европой, включая и вступление в ВТО (Всемирная торговая организация), и участие в рынке образовательных услуг.
Второй этап (1995 – 1998 годы). Модернизация системы высшего образования, обновление ее содержания.
Третий этап (1999 –2000 годы). Децентрализация управления и финансирования образования, расширение академических свобод организаций образования.
Четвертый этап (начало - 2001 г.). Стратегическое развитие системы высшего профессионального образования.
В Республике Казахстан законодательно закреплена следующая структура высшего профессионального образования:
- высшее базовое образование (бакалавриат);
- высшее специальное образование;
- высшее научно-педагогическое образование (магистратура).