Цитоплазматична мутація — зміни позаядерних спадкових факторів (плазмагенів), які знаходяться в ДНК- вмісних органоїдах цитоплазми (пластидах і мітохондріях)., передається тільки по материнській лінії. Кожна мутація починається із зміни генетичного матеріалу лише однієї клітини, і її потомство (дочірні клітини) повністю успадковує структурну зміну як естафету. З клітин, які зазнали мутаційних змін, виникають мутанти. Клітини багатоклітинного організму відрізняються за хімічним складом, функціями, розміщенням та фізіологічним станом. Це забезпечує їх значну автономність у ході мутаційного процесу. Вона полягає в тому, що клітини змінюються незалежно одна від одної; вони не мутують однотипно, і структурна зміна кожної з них може бути і буває неповторною, своєрідною.