Метод аналогий состоит в использовании опыта структур управления в аналогичных организациях и предусматривает выработку типовых структур управления в различных видах организаций, определение различных рамок, условий и механизма применения.

Экспортно-аналитический метод состоит в изучении рекомендаций и предложений экспертов и опытных управленцев – практиков. На основе опроса экспертов осуществляются диагностический анализ организационных структур действующих фирм и их оценка.

Метод структуризации целей состоит в выработке системы целей организации, включая их количественную и качественную формулировки, и последующий анализ организационных структур с точки зрения соответствия системе целей.

Метод организационного моделирования состоит в разработке формализованных математических, графических, машинных и других отображений распределения полномочий и ответственности в организации, являющихся базой для построения, анализа и оценки различных вариантов организационных структур, по взаимосвязи их переменных.

Процесс проектирования организационной структуры можно организовать по трем крупным стадиям:

1. Предпроектный– установление самого факта существования проблемы:
   1. Анализ объекта управления.
   2. Анализ организационной структуры управления.
   3. Анализ управленческого персонала.
   4. Проектное задание – техническое задание или технико-экономическое обоснование.
2. Проектный этап – детальное описание организационной структуры управления, подлежащей проектированию:
   1. Проект организационной структуры управления;
   2. Требования к организационной системе;
   3. Требования к персоналу;
   4. Оценка эффективности. Сопоставить с проектным заданием. Даёт ли проект совершить, что задумано.
3. Этап реализации:
   1. Согласование или утверждение проекта;
   2. Оформление проекта в вид, который будет иметь возможность быть принятым организацией;
   3. Внедрение, мониторинг, коррекция.