Черная субстанция, являясь одной из структур среднего мозга, относится к центрам экстрапирамидной системы. Данная структура представлена билатеральным скоплением клеток, которые расположены между основанием ножек мозга и их покрышкой. Черная субстанция состоит из ретикулярной и компактной частей.
Функции черной субстанции в основном связывают с регуляцией моторной функции и тонуса мышц. Совместно с другими центрами экстрапирамидной системы черная субстанция осуществляет статокинетическую функцию. Она регулирует и координирует мелкие и точные движения, в частности, пальцев; координирует процессы жевания и глотания. Имеются данные о роли черной субстанции в регуляции многих вегетативных функций: дыхания, сердечной деятельности, тонуса кровеносных сосудов. Электростимуляция черной субстанции вызывает увеличение артериального давления, частоты сердечных сокращений, частоты дыхательных движений.