Центр може мати такі структурні підрозділи:
• відділення роботи з безпритульними дітьми;
• відділення екстреної (первинної) допомоги;
• відділення соціальної реабілітації;
• відділення ресоціалізації;
• відділення сімейної адаптації;
• юридична служба;
• служба "Телефон довіри для дітей";
• відділення тимчасового проживання;
• відділення професійної орієнтації та трудового навчання;
• інші структурні підрозділи, діяльність яких пов'язана із соціально-психологічною реабілітацією дітей.
