- осуществляет контроль и надзор: за использованием средств федерального бюджета, государственных внебюджетных фондов; за исполнением законодательства о финансово-бюджетном контроле и надзоре; за соблюдением валютного законодательства и др.
- проводит в организациях любых форм собственности встречную проверку;
- направляет в проверенные организации обязательные представления или обязательные предписания по устранению выявленных нарушений;
- осуществляет контроль за своевременностью и полнотой устранения нарушений законодательства в финансово-бюджетной сфере, в том числе путем добровольного возмещения средств;
- заказывает проведение необходимых испытаний, экспертиз, анализов и оценок по вопросам осуществления надзора в установленной сфере деятельности;
- осуществляет контроль за деятельностью территориальных органов Службы и подведомственных организаций и др.