Есть три способа устранения медиатора из синаптической щели:
- Белки ферменты разрушают медиатор в синаптической щели. Происходит химический распад медиатора при помощи белка фермента.
- Обратный захват в окончание пресинаптической области. Белки транспортёры, встроенные в пресинаптическую мембрану, взаимодействуют с медиатором и, при помощи энергии, происходит обратный захват медиатора обратно в пресинаптическое окончание.
- Захват медиатора глиальными клетками (фагоцитами), которые поглощают медиатор в межклеточной жидкости.
