В настоящее время состояние биоиндикации характеризуется следующими важнейшими особенностями.
• признание важности использования биоиндикаторов на всех уровнях организации живого,
• предпочтение интегрированных показателей состояния биологических систем,
• рост шкал исследования из-за понимания, что локальная угроза может стать региональной и биосферной,
• переход от точки зрения, что оптимальным является состояние природы до вмешательства человека, к распознаванию многих «приемлемых» состояний под влиянием человека,
• понимание необходимости распознавать ранние симптомы нарушения, пока расходы на восстановление не стали слишком велики.