Хозяйственное вмешательство человека в экологические системы морей Северного Ледовитого океана обострило здесь ситуацию, особенно в последние годы. Главная причина — непомерная нагрузка на хрупкие и трудно восстанавливаемые аквальные комплексы северных морей.
В настоящее время проблемы Северного Ледовитого океана сводятся к следующим:
-перелов морепродуктов (моллюсков, ракообразных, рыбы), непомерная добыча морского зверя (тюленей, моржей);
-большое шумовое загрязнение (нарушение тишины постоянными пневмовзрывами — гидроудары, электроразряды, геофизическая разведка, шум двигателей судов);
-загрязнение акваторий нефтью, нефтепродуктами, ядохимикатами, мусором с берега и кораблей, сброс бытовых стоков;
-повышенный радиоактивный фон (особенно в европейском секторе), захоронение радиоактивных отходов (например, на Новой Земле);
-кислотные дожди, выпадающие на поверхность морей.