1) Міссенс-мутації (транзиції, трансверсії). Виникають при зміні нуклеотиду всередині кодону. Це призводить до вставки на певному місці в ланцюзі поліпептиду іншої амінокислоти
2) Нонсенс-муцтації (транзиції, трансверсії) – поява всередині гена кінцевих кодонів за рахунок зміни окремих основ в межах кодонів
3) Мутації зсуву рамки зчитування. Виникають при появі всередині гена вставок основ і делецій